Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TSPOP30536 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPOP30536 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPOP30536 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms