Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4AP27815 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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