Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARK3P27448 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARK3P27448 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARK3P27448 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARK3P27448 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARK3P27448 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARK3P27448 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARK3P27448 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARK3P27448 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MARK3P27448 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARK3P27448 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms