Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFRP26992 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms