Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms