Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms