Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AREGP15514 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AREGP15514 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AREGP15514 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AREGP15514 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AREGP15514 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms