Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRF1P14222 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRF1P14222 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRF1P14222 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRF1P14222 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRF1P14222 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRF1P14222 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRF1P14222 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRF1P14222 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms