Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GP1BBP13224 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms