Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP3P12645 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP3P12645 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP3P12645 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP3P12645 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP3P12645 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BMP3P12645 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BMP3P12645 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BMP3P12645 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BMP3P12645 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BMP3P12645 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP3P12645 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms