Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RLBP1P12271 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RLBP1P12271 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms