Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms