Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODC1P11926 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ODC1P11926 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ODC1P11926 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODC1P11926 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODC1P11926 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODC1P11926 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODC1P11926 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODC1P11926 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms