Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms