Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms