Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB7P09629 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB7P09629 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms