Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA5P08648 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms