Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP3P08254 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP3P08254 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MMP3P08254 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MMP3P08254 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP3P08254 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP3P08254 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms