Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NGFRP08138 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NGFRP08138 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NGFRP08138 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NGFRP08138 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NGFRP08138 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms