Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB1P08034 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB1P08034 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB1P08034 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB1P08034 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms