Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PF4P02776 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PF4P02776 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PF4P02776 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PF4P02776 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PF4P02776 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PF4P02776 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4P02776 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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