Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB11O95342 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB11O95342 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms