Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN15O75808 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN15O75808 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms