Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF40AO75400 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms