Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3BO75182 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms