Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG13O75143 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG13O75143 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG13O75143 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG13O75143 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms