Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9AO75110 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9AO75110 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms