Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYNCRIPO60506 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNCRIPO60506 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms