Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF3O43395 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms