Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLOCKO15516 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms