Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms