Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP23O00161 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms