Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01387J3KSC0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms