Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA8SH3BPF8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA8SH3BPF8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms