Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms