Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPA5E9PKD4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms