Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms