Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF879B4DU55 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms