Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms