Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM223BA6NKX1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM223BA6NKX1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms