Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms