Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 OR7E102P-201ENST00000448855 1015 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ZNF174-205ENST00000575752 1068 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC090099.1-204ENST00000623626 849 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PACRG-202ENST00000366888 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PHACTR1-204ENST00000379348 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AL034372.1-201ENST00000407586 754 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 PYHIN5P-201ENST00000431627 723 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RPL22P11-201ENST00000434894 385 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC022400.2-201ENST00000446730 866 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RTL8BQ17RB0 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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