Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 IKZF3-207ENST00000377944 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 IKZF3-208ENST00000377945 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL133279.3-201ENST00000563140 2352 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TSSK4-201ENST00000287913 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OR2L1P-201ENST00000422727 938 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OSBPL10-AS1-204ENST00000436598 513 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC068042.1-201ENST00000482222 1148 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC008708.2-201ENST00000522956 1124 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GS1-279B7.1-201ENST00000562817 399 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC116348.2-201ENST00000563751 577 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SPINT1-AS1-204ENST00000568419 629 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC007346.1-202ENST00000602826 684 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CRYAB-216ENST00000616970 977 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC245033.3-201ENST00000617986 224 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01778-208ENST00000635288 1095 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ITM2A-202ENST00000434584 1698 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CU633967.1-204ENST00000624627 1604 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL512604.2-201ENST00000426946 1314 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms