Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 IREB2-208ENST00000560440 4396 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PABPC4L-201ENST00000421491 4944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MAPK10-279ENST00000641157 2449 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 TMEM231-201ENST00000258173 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MYO5A-202ENST00000358212 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 DCAF4L2-201ENST00000319675 3326 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC011294.1-202ENST00000451905 1947 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 SCRN1-201ENST00000242059 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 SUN3-202ENST00000395572 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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PTPRMP28827 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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PTPRMP28827 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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PTPRMP28827 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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PTPRMP28827 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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PTPRMP28827 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AMOTL1-202ENST00000317829 8844 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL450468.1-201ENST00000415166 450 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PTPRMP28827 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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