Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 C22orf46-201ENST00000402966 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 FRMPD1-203ENST00000539465 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 CAPNS1P1-201ENST00000401029 633 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 GPRC5D-AS1-202ENST00000499948 1746 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 ABCC11-202ENST00000356608 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 IL5RA-203ENST00000383846 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 SIK2-201ENST00000304987 9678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 MPI-202ENST00000352410 5828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 BECN1P2-201ENST00000407947 812 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
XIRP2A4UGR9 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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