Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 PCBP1-AS1-212ENST00000418308 863 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AC022400.2-201ENST00000446730 866 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AC002463.1-201ENST00000453459 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 QTRT2-215ENST00000493014 1046 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AC063923.2-201ENST00000562158 928 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AC100843.2-201ENST00000589084 324 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
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SCN2BO60939 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SCN2BO60939 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 TBC1D21-202ENST00000535547 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 AC103724.4-201ENST00000605981 292 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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