Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AF127577.3-201ENST00000430391 781 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 LINC02024-203ENST00000496994 489 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL358332.1-201ENST00000555649 813 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 ELMO2P1-202ENST00000614283 794 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AP000851.2-201ENST00000629499 721 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 KLRB1-201ENST00000229402 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 IRAK4-202ENST00000440781 1409 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 OR2T4-201ENST00000366473 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 OR2T4-202ENST00000366475 1047 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 SP140-202ENST00000373645 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 GZMB-203ENST00000382542 666 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTGFRP43088 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC010983.1-201ENST00000418387 1028 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 CREM-224ENST00000468236 582 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 BX890604.1-206ENST00000471090 922 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTGFRP43088 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 OVCH1-AS1-201ENST00000549411 743 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC144548.1-201ENST00000549577 324 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC006547.1-208ENST00000598339 805 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 FAM184A-213ENST00000617072 1251 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGFRP43088 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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