Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms