Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRAPPC8Q9Y2L5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms