Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCE1Q9Y256 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RCE1Q9Y256 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms